QuantaCell est expert dans le traitement des images et dans l’analyse de données destinées aux applications biologiques

QuantaCell est un prestataire de service (CRO ou contract research organization) basé à Bordeaux. Son but est de proposer des solutions informatiques sur mesure pour l’imagerie biologique allant de l’échelle des organes à celle de l’échelle de la molécule en passant par l’échelle des cellules.

 

Que peut faire QuantaCell pour vous ?

Accélérer vos analyses d’images et automatiser vos expériences pour gagner du temps

  • Passer du qualitatif au quantitatif en transformant les phases manuelles en phases automatiques
  • Enchaîner automatiquement toutes les étapes d‘analyse d’images ou de données (filtrages, segmentations, machine learning, tests statistiques)
  • Utiliser des outils extrêmement rapides et fiables (C++, CUDA, multi-threading)

Améliorer la qualité de vos résultats pour gagner en précision et pour augmenter la robustesse des mesures

  • Utiliser des outils adaptés à vos données et à vos modèles biologiques
  • Visualiser vos résultats avec des outils dédiés pour garantir des rendus sans erreurs
  • Tester l’impact des artefacts et limiter les biais instrumentaux
  • Valider la robustesse et la reproductibilité de vos expériences

Gérer vos « Big Data » pour croiser les données et visualiser les informations sensibles

  • Croiser les données de votre laboratoire avec des données publiques
  • Compiler des milliers d’expériences pour détecter les résultats les plus significatifs
  • Retrouver de l’information cachée dans les masses de données grâce à des outils adaptés de visualisations et des outils d’apprentissage statistique
  • Combiner et visualiser des données hétérogènes (bio-informatique, protéomique, génomique, clinique, médicale) et issues de technologies différentes (imagerie,  spectrométrie de masse, cytométrie en flux, microarray)

Améliorer l’utilisation de vos systèmes d’imagerie pour des résultats plus quantitatifs

  • Calibrer les microscopes (imageurs)  et augmenter le contraste pour une quantification optimale
  • Détecter les erreurs instrumentales (flou, décalage spatial, dérive) et les corriger
  • Intégrer des logiciels d’analyse d’image dans la phase d’acquisition des images

Développer des solutions logicielles sur mesure

  • Programmer des interfaces utilisateurs simples et ergonomiques
  • Mettre en valeurs des données et des résultats importants
  • Utiliser les frameworks modernes (.NET, QT, Java) pour des interfaces graphiques fluides
  • Intégrer dans les logiciels les algorithmes d’analyse d’images et de statistiques les plus innovants et les plus récents

 

Pourquoi choisir QuantaCell ?

  • Pour notre double compétence en biologie et en informatique
  • Pour notre capacité d’adaptation aux spécificités et aux besoins de nos clients
  • Pour notre disponibilité et notre flexibilité
  • Pour notre longue expérience dans l’analyse des données et de l’imagerie biologiques

 

À qui s’adressent ces prestations ?

  • Industrie pharmaceutique (phases précoces et précliniques et cliniques)
  • CRO (contract research organization)
  • Industrie cosmétique
  • Société de biotechnologie
  • Hôpitaux eten particulier aux laboratoires d’anatomopathologie
  • Laboratoires académiques (CNRS, INSERM, CEA et INRA)

 

Les champs d’application de QuantaCell sont très variées

Biologie cellulaire (signalisation et trafic cellulaire, identification de cibles…)

Comptage cellulaire, comptage nucléaire, translocation, viabilité cellulaire et apopthose, angiogenèse, cycle cellulaire, granularité, segmentation cellulaire, suivi dans le temps (tracking), analyse des morphologies cellulaires, détection de phénotypes

Biologie du développement (embryologie, vers, drosophile, poisson zèbre)

Reconstruction 3D, analyse dans le temps, suivi des cellules uniques, déformations géométriques, détection des organes, filiation cellulaire, recalage des images, information des structures tissulaires

Neurobiologie (neuroscience)

Organisation neuronales (neurones, axone, neurites, astroglia), dynamique des récepteurs membranaires en SPT (single particle tracking)

Oncologie

Analyse histologique, détection et morphologie des tumeurs, angiogenèse, mesures des vaisseaux et des micro-vaisseaux, aire et intensité des biomarqueurs, dynamiques cellulaires (prolifération, migration, invasion)

Dermatologie et cosmétiques

Détections des structures tissulaires cutanées (derme, épiderme, hypoderme), détection de l’orientation et de l’organisation des fibres de collagènes

Clinique

Analyse des structures tissulaires en histologie, biomarqueurs, test diagnostique « compagnon », analyse phénotypique, angiogenèse, TMA (tissue micro array)

Histologie

Analyse IHC / H&E / Fluo / FISH, détection des structures tissulaires (épithélium, tissus conjonctifs, lumières), quantification cellule par cellule, détection de tumeurs, mesure de l’organisation, angiogenèse et vascularisation

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