L’exemple présente les résultats d’un microarray du kinome complétés par des données publiques. Les données du microarray sont présentées à gauche. L’utilisateur sélectionne un gène (MAP4K3 puis MAP3K1) et les données publiques apparaissent dans les fenêtres à droite afin de croiser les information utilisateur avec les informations publiques.

Accès aux informations biomédicales dans les bases de données publiques

Des informations publiques des gènes sélectionnées sont récupérées automatiquement à partir de plusieurs bases de connaissances publiques :

• GeneCard (http://www.genecards.org/)
• Gene Ontology (accédé par GeneCard)
• HumanProtein Atlas (http://www.proteinatlas.org/) donne la localisation des protéines dans les modèles cellulaires, dans les tissus de nombreux organes cancéreux ou sains
• EMAGE (http://www.emouseatlas.org/) fournit les expressions des protéines dans les embryons de souris
• STRING (http://string-db.org/) donne les données des intéractomes

De la même manière, l’intéractome de MAP4K3 est affiché dans la fenêtre de droite et chaque gène de l’intéractome sont sélectionnées dans les données du microarray.

Ces informations sont intégrées dans les interfaces graphiques des logiciels pour permettre une interactivité optimale.

Cette stratégie permet à l’utilisateur d’avoir un maximum d’éléments et de mieux interpréter le résultat de l’expérience.